从2013年秋到当前，我国H5亚型高致病性禽流感有多个不同流行毒株同时存在。按基因型划分：分布在2.3.2、2.3.4、7.2三个分支上。其中，感染鸡的有2.3.2分支的H5N1，2.3.4分支的H5N1、H5N6、H5N8，7.2分支上的H5N1(两种类型)、H5N2(两种类型)。感染水禽的有2.3.4分支的H5N2、H5N6、H5N8，或许还有2.3.2分支的H5N1。
目前，中国发生感染的地域扩大了，当前我国鸡和水禽的感染都呈散发，夏季发生明显减少。H5N6多在东南亚诸国，东南诸省，并逐渐向北推进，是主要流行株;H5N8多在中原和北方地区，己很少发生;7.2分支上H5N2亚型毒在北方仅有零星发生;2015年秋、冬，2.3.2分支出现了一个新变异株(2.3.2.1.c)，已逐渐成为全国性主要流行毒株。其末来变化还需要在实际流行状况的观察中做出判断。
禽流感病毒从2013年秋开始，病毒进入快速变异期，由过去2~3年出现一个流行毒株变成短时间内突然出现3个基因型十几种毒株并存的局面。新毒株还表现出多亚型(H9N2、H5N1、H6N6、H5N2、H7N9、H5N8、H5N6、H3N2、H3N8等)重组的特点。这种多变的现象在2014年后虽有渐缓但至今没有停止的迹象。因此，加强监测尽早发现可能出现的新变异流行毒株是重之又重的防控研究工作。
其监测和诊断时要注意：疫苗内含物和监测用抗原不相符合。疫苗可能含有变异株但监测用抗原是标准株。监测结果可能和实际不符。检测到H5PCR阳性时，一定要结合生产实际，观察临床表现，结合剖检变化进行综合判断。病毒分离和鉴定是终诊断
该病仍以疫苗防控(Re-8、Re-7、Re-6三种疫苗)为主。其中，南方主要选择Re-8、Re-6疫苗进行防控，而北方则建议选用Re-6、Re-7、Re-8三种疫苗一起进行免疫防控。在免疫程序的设定方面，一般是在10天左右、30天左右、开产前、高峰期后四个阶段分别进行免疫，此外，在换羽鸡开产前，要加免一次。过程中要注意：开产前和高峰期后要用新2.3.2分支新变异株、2.3.4分支新变异株(Re-8是用2.3.4分支H5N1毒株制备的，当前用H5N6相对好一些)。
在疫苗的选择方面，还需要注意：索取和疫苗内相符的监测抗原做HI交叉试验，判断是否为所需变异株。索取和疫苗内相符的监测抗原做HA片段PCR检验并对结果测序，判断是否为所需变异株。疫苗厂家技术报告中要对攻毒用毒株特别关注，要用真正的当前流行的变异株。判定要用排毒结果，不能只看有无死亡。可用剖检变化做判断。
在养殖场日常防控措施方面，要注意根据外界流行情况适时加强隔离、消毒。特别警惕周围水域的野生水禽，防止野生水禽→鸟→家鼠→饲养舍的传播链条的形成。
对于其发病后的防控，要注意：早诊断有利于控制传播。当出现不正常死亡病例有禽流感可疑时，对发病的群体隔离、淘汰处死、彻底消毒有很大的好处。同一时刻可对尚未感染相邻栋舍做针对性疫苗的紧急接种，做好隔离封锁。这种情况下，一旦可维持7~10天不发病，损失会大大降低。要特别注意防止集团内部不同饲养场之间运输工具、蛋筐、蛋托、种蛋、饲料、人员的交叉和运输污染而形成的传播。防控不仅仅是针对发生问题场区开展隔离、封锁、消毒。
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